生物类消毒法是利用动植物、微生物及其代谢产物杀灭或去除外环境中的病原微生物。主要用于水、土壤和生物体表面的消毒处理。目前可用作消毒的生物有下述几种：
     一、细菌
     当前可用于消毒的主要是噬菌蛭弧菌。它可以裂解多种细胞，包括霍乱弧菌、志贺氏菌、大肠杆菌、沙门氏菌等，用于水的净化处理。其他细菌，例如梭状芽孢菌，类杆菌属中某些细菌，可用于污水、污泥的净化处理。
     二、微生物代谢等产物
     一些真菌和细菌的代谢等产物如毒素，具有抗菌或抗病毒作用，亦可用作消毒或防腐。例如由酶菌产生的霉酚酸、青霉酸、木支青梅酸、展青霉酸等具有杀菌和杀病毒作用。SY-30大肠菌产生的大肠菌素，可杀灭致病性大肠杆菌。
     三、噬菌体
     一些广谱噬菌体，便如T6、T1等可裂解多种细菌，有可能在消毒和防腐上应用。
     四、溶菌酶
     最近有人研制了一种金黄色葡萄球菌溶菌酶，单独或与其他消毒剂伍用，具有较好的杀菌作用。